农心杯世界围棋团体锦标赛的前身为SBS杯三国围棋擂台赛、真露杯三国围棋擂台赛。SBS杯仅在1991-1992年期间举办了一届，而真露杯则在第5届比赛结束后宣布了停办。

1998年，农心杯开始组织运作，首届比赛于1999年启航，擂台赛终于重新开赛。至2019年2月，农心杯已经顺利结束了20届。

第一届农心杯第一阶段于1999年12月16日在中国上海拉开序幕，韩国先锋睦镇硕连赢日本先锋山下敬吾和中国先锋邱峻，但在第三局输给日本棋手工藤纪夫，第四局工藤纪夫败于罗洗河手下。第一阶段以中国棋手的胜利结束了，此时距离2000年元旦还有12天。

2000年1月18日，第二阶段如期开战，四局比赛放在了日本东京。第二阶段第一局，罗洗河执白193手中盘负金荣三，但之后金荣三未能敌过依田纪基，王磊也在与依田的交手中败下阵来。之后韩国“围棋皇帝”曹薰铉出马，以执白256手中盘胜结束了第二阶段的比赛。

两个月后，决赛阶段在韩国首尔农心集团总部开赛。彼时24岁的中国大将常昊执白3.5目击败曹薰铉，并连胜山田规三生、刘昌赫，成为第一届农心杯连胜最多的棋手。可惜的是常昊在随即与日本棋手赵善津的交手中，以2.5目的差距退出了争夺。

李昌镐多次为韩国捧走冠军

最后两局比赛，25岁的韩国先锋李昌镐亮相擂台赛，先后执白中盘胜日本主将赵善津和日本主将马晓春，终结了比赛，第一次让大家领教了农心杯上的韩国“铁门”。李昌镐为韩国队捧走了第一届农心杯的冠军奖杯，拿走了1亿2000万韩元（约70.2万人民币）的奖金，而中国队的首届农心之旅则以亚军结束。

首届比赛战况激烈，中国棋手和日本棋手的战绩相同，为4胜5负，韩国棋手总共6胜4负。

首届农心杯阵容和战绩：

中国队：邱峻（1负）、罗洗河（1胜1负）、王磊（1负）、常昊（3胜1负）、马晓春（1负）

日本队：山下敬吾（1负）、工藤纪夫（1胜1负）、依田纪基（2胜1负）、山田规三生（1负）、赵善津（1胜1负）

韩国队：睦镇硕（2胜1负）、金荣三（1胜1负）、曹薰铉（1胜1负）、刘昌赫（1负）、李昌镐（2胜）